第一章夜晚的黑兰德少年军驻地，安祥的氛围笼罩着每一个年轻战士，和平协议已经在黑兰德和都市同盟之间签订，主人公和他的童年好友乔伊也正计划着回家乡和七美团聚，七美是主人公的义姐，也是他在这个世界上唯一的亲人。一阵厮杀声打破了夜的清静，“敌人偷袭！”帐外传来嘈杂的喊喊。
队长劳德告诉他们，是都市同盟撕毁了和平协议朝少年军发起突袭，他意见他们从东边的森林逃跑。东边森林是逃跑的必经之路，敌人极有可能设下潜伏，乔伊觉得事有蹊跷，便和主人公原路返回。不料在军驻地偷听到劳德与黑德兰王子卢卡·布莱特的谈话，原来卢卡不满和平协议，带领手下发起所谓偷袭嫁祸都市同盟，意在挑起战端。
知道了整个阴谋的主人公和乔伊，向北边悬崖逃命。卢卡命劳德一路追杀，乔伊和主人公被迫跳下山崖，并在悬崖石壁上作下记号，两人约定假如失散，回此地找觅对方。悬崖脚下的水流边，雇佣军队长维克多救醒了主人公，并将主人公当作俘虏带回了雇佣军山寨。主人公受到了不错的礼遇，并扶助山寨干活。
夜晚，乔伊潜进山寨企图救走主人公，行踪败露后，两人被重新关回小房间。 当晚，乔伊带着主人公再次逃跑，这次成功出逃。乔伊和主人公决定回家乡卡罗街往找七美，他们需要穿过燕北坡，但传说坡上有厉害的妖怪。途经柳拜村，主人公结识了一群流浪艺人，他们也正愁找不到人一起穿越燕北坡，于是大家结伴上路。
燕北坡上，主人公碰到了游戏里的第一个Boss--雾妖。 卡罗街，主人公家中，七美正跪在玄客的墓前祷告，她和主人公都是玄客一手抚养大的。七美见主人公平安回来，十分兴奋，她突然想到，主人公和乔伊会不会就是街上盛传的扶助都市同盟袭击少年军的叛徒“少年二人组”。
七美劝导主人公赶紧逃跑，并告诉主人公，无论他做了什么，她都会支持他的。主人公和七美拜别玄客墓后，正预备离家，却被一群王国军俘获。另一边，乔伊的养父母认为乔伊是令家族蒙羞的叛徒，将乔伊亲手交给王国军处置。主人公、乔伊和七美三人相聚在王国的牢房里。
乔伊质问劳德当时都市同盟的偷袭究竟是怎么回事，劳德告诉他们这全是黑兰德皇子卢卡·布莱特的阴谋。都市同盟的偷袭导致王国军少年兵全军覆没，由此引发的战乱，是实现卢卡野心的必要手段。劳德公布，主人公和乔伊将被处以死刑。押赴刑场的路上，乔伊和主人公碰到了黑兰德公主吉尔，乔伊告诉公主，他们是被冤枉的。
刑场上，主人公和乔伊被鞭打，对着夕阳，劳德感叹自己步步高升的大好前途，紧急时刻维克多和弗里克赶到，救下二人。主人公和乔伊赶到大牢欲营救七美，不料七美早凭借独门武功绝学打倒了保护顺利逃脱。一行三人站在卡罗街口，想到这次离开家乡不知道何时才能回来，不禁心绪黯然。
再次返回雇佣军山寨，维克多不再限制主人公的行动。三人的心绪在自由的生活中慢慢平复。山寨人手不够，三人四处游荡，为山寨觅觅同伴。一行三人在托托村口遇见了乔伊的救命恩人——一个可爱的小女孩比丽佳。为给爸爸过生日，比丽佳将自己的零花钱交给主人公和乔伊，挣脱他们从妙芝的道具屋里买个木质护身符回来当作礼物。
主人公一行人带着护身符从妙芝返回托托时，却发现托托已被烧成一片灰烬。村民尽死，比丽佳在父母的保护下得以幸存，一个人在废墟中哇哇哭抽泣。爱普露出现，告知一切为卢卡所为，并要求主人公一行带她回山寨见维克多。山寨大厅，维克多、主人公、乔伊商量作战事宜。
用以对付王国军的武器“火炎枪”已经损坏，蔡是唯一会修理的人，他的家位于柳拜村的后山上。主人公从维克多处取得资金，穿过山路找到蔡，蔡答应助一臂之力，跟随主人公前往山寨。不料返回柳拜时，发现柳拜已经被王国军占据，卢卡纵火烧村，滥杀无辜。主人公和乔伊愤恨，意欲上前拼命，蔡劝阻不成，只能打昏二人。
维克多在山寨大厅会见了蔡。他让乔伊和主人公先往妙芝躲避风头，二人要求为战争出一己之力，山寨于是拨了一支队伍给二人，二人为自己的部队命名。王国军部队朝山寨进军，爱普露担任军师出谋划策。由于敌人发起连续两轮进攻，雇佣军不敌，山寨失守。乔伊和主人公在卢卡手上救下比丽佳，逃往妙芝。
逃亡途中经过托托村，在比丽佳指引下，乔伊和主人公进进一个看起来用于祭奠的山洞中。山洞尽头立有一块石碑，上面刻有玄客的话。 正在大家推测之际，突然一道光闪，乔伊和主人公已经穿越石碑背后的洞壁，站在他们对面的是莱克那多，她是门之纹章的继续者，平稳的执行者。
莱克那多称“开始的纹章”观察了乔伊和主人公的童年事迹，已经认可他们的资格，他们将被赋予改变命运的力量。不同的洞穴里，主人公被附宿了“辉盾纹章”，乔伊被附宿了“黑刃纹章”。妙芝城外，因为没有通行证，守城将士拒绝主人公一行进内，脾气火爆的七美和保护起了争执，最后被主人公和乔伊拉走。
无奈之下，一行人转往妙芝东边的白鹿亭歇脚。白鹿亭旅馆的男主人阿列克斯发现辛达尔族遗迹进口，他坚信那里躲有宝躲，期看能找到宝躲让妻儿生活得更好。主人公答应陪阿列克斯进遗址觅觅宝躲，但条件是在找到宝物以后能借阿列克斯一家进妙芝的通行证一用。辛达尔族遗迹中机关密布，众人历经艰险终究找到宝箱，但宝箱里面只有一株草药。
阿列克斯一怒之下把草药丢在遗迹进口。返回旅馆，却发现阿列克斯的妻子，旅馆的女主人希尔达得了急病，高烧不退。大家一片束手无策之际，主人公从遗迹口捡回草药，希尔达服用后立刻康复。阿列克斯守信，把通行证借给主人公。妙芝城前，依据七美提议，主人公假扮阿列克斯，七美假扮希尔达，乔伊假扮儿子，被保护一眼识破，主人公一行因此被投进妙芝监狱。
夜晚，妙芝大牢里，看着明净如水的月色，乔伊回想起童年往事，期看将来能过上清静的生活。翌日，维克多把大家从牢中接出。将比丽佳安置在酒馆老板丽奥娜处之后，维克多约乔伊、七美和主人公在妙芝市政厅见面。那里他们见到了妙芝的女市长阿那贝尔，阿那贝尔似乎对三个人的身世都很了解。
结束和阿那贝尔的谈话之后，三人碰到了市长亲信杰斯，他挣脱乔伊和主人公穿上王国军少年军服，潜进王国军驻地调查敌军的粮草储备。主人公和乔伊很顺利就进进粮库，但出来时正好碰见原少年军队长劳德。二人被围堵之际，躲进了公主吉尔的军帐。吉尔打发走了追兵，安顿二人逃走。
军驻地进口，二人再次被劳德拦截，为掩护主人公和候在外面的七美，乔伊独自留下对付王国军。七美和主人公成功逃脱。得知将如此危急的任务派给几个孩子往完成，阿那贝尔怒斥杰斯。乔伊许久没有返回，七美担心，跑到妙芝城门口等候乔伊回来。日落时分，乔伊才出现，满天暮霞下，七美和比丽佳欣喜地拥抱住平安返回的乔伊。
谁也不知道，他们的人生正在偏离原先的轨迹，并且渐行渐远……听说有都市同盟大会将在琼斯顿山召开，会议针对如何抵御卢卡·布莱特在都市同盟境内的残暴行径进行商讨。大会上，同盟国成员貌合神离唇枪舌剑指桑骂槐，只是急于保护自己而置同盟利益于不顾。会议召开中途，突然传来了王国军朝妙芝进军的消息，各市长结集自己的军队预备反抗。
阿尔贝那挣脱维克多出兵挈住王国军几天，维克多答应。主人公和乔伊也期看能为战斗奉献一己之力，阿尔贝那答应等战争结束，告诉他们玄客的故事。王国军的领军是索·洛基。除了雇佣军，都市同盟参战的还有骑士团。战争进行一半，由于接到古尔德团长的命令，骑士团撤军。
雇佣军仍然成功挈延了敌军。战争结束之后，丽奥娜的酒馆里，乔伊在房间里和陌生人讲话，被比丽佳撞见，乔伊掩饰过往。翌日，主人公三人到市政厅处听阿那贝尔讲玄客的故事，恰逢南窗市市长古兰梅亚和天驼市市长古斯塔夫在办公室里起争执。阿那贝尔让三人晚上再往找她。
傍晚，七美和主人公再次往市政厅。大门一侧，一个陌生人和乔伊讲完话后消失了，主人公询问是谁，乔伊支吾不答。乔伊说战争不可能在短期内结束，他劝导主人公和七美离开，并嘱咐假如自己死了，一定要好好照顾比丽佳。说完这番意味深长的话之后，乔伊匆匆离开。深夜，维克多带着南方的好酒来见阿那贝尔。
两人在房里小酌交谈，聊战争，聊生活，聊妙芝的未来，也聊两个人对彼此朦胧的感觉。夜慢慢深了……主人公和七美再次找阿那贝尔听故事，却遇见乔伊从阿那贝尔房间慌张跑出。进进房间后，主人公和七美发现阿那贝尔倒在血泊之中。原来乔伊早一步找到了阿那贝尔，他告诉阿那贝尔他是来取她的性命的，并且他有足够的理由这么做。
阿那贝尔企图设计反抗，但终究死在乔伊手上。王国军攻进妙芝。杰斯前来通报，误以为主人公是杀人凶手，主人公和七美百口莫辩。形势紧急，二人只好带上比丽佳匆忙出逃，维克多和大家约好在南窗汇合。半夜，主人公、七美和比丽佳筋疲力尽。三人在树下随便休息了一宿，朝着南窗的方向继续逃亡。