明日,我们特邀新格元单细胞测序产物司理张雅轩密斯做客序祯达曲播间,为各人带来序祯达生物单细胞平台新品曲播:ProMoSCOPE™高通量单细胞糖基化检测计划描画细胞外表糖基化图谱,更多出色内容抢先看以下单细胞糖基化检测的手艺内容分享。
PART 01
审时度势看布景
糖基化做为一种常见的卵白翻译后润色,在实核细胞中普遍存在,差别细胞类型的糖基化在类型和数量上也有较强的异量性。在糖基转移酶感化下将糖类转移至卵白量,与卵白量上特殊的氨基酸残基构成糖苷键是糖基化的根本过程。细胞膜外表的糖基化能够增加膜卵白的不变性,也是细胞膜外表信号的特征之一。
图自Glycosylation in cancer: mechanisms and clinical implications
在组织和细胞中,糖基化次要参与调控卵白量的定位、功用和活性,影响细胞识别、分化、信号转导、免疫应答等多种重要的生命活动。糖基化异常可招致肿瘤、糖尿病、心血管和神经退行性疾病等多种病症。好比,与一般细胞比拟,肿瘤细胞表示出普遍的糖基化改动,进而增加肿瘤异量性,还能够通过聚糖连系受体诱导免疫按捺信号。又或者,体内的葡萄糖分子或其他糖类分子错误地毗连到卵白量上,会引起卵白量变性,那一有害反响与氧化反响类似,也是引发糖尿病并发症的重要因素。
PART 02
化繁为简识手艺
近年来,糖基化的相关研究逐步增加,呈“突飞猛进”的趋向;而单细胞程度的糖基化研究还不多。一方面单细胞糖基化手艺还不成熟;另一方面,scGR-seq、SUGAR-seq等办法尚未走出尝试室,目前还没有一个易用的、贸易化的单细胞糖基化手艺。
糖基化NCBI文章颁发数量图
序祯达生物单细胞平台:ProMoSCOPE™高通量单细胞糖基化处理计划来啦!
原理
ProMoSCOPE™单细胞糖基化检测手艺,是首个贸易化的在单细胞分辩率下同时检测单细胞转录组和细胞外表糖基化的手艺。基于酶促糖基化原理,在测序前颠末糖基转移酶毗连Tag,为细胞轻松带上糖基化“小标签”。
ProMoSCOPE™原理图
流程
ProMoSCOPE™具有简单的工做流程,可同时阐发数千个细胞的糖基化程度,适用于疾病机造和肿瘤侵袭、肿瘤异量性研究、免疫应答研究和宿主-病原体彼此感化等标的目的的研究。
ProMoSCOPE™流程图
ProMoSCOPE™拥有从样本造备到数据阐发的完好流程:
⚪操纵ProMoSCOPE™毗连样本细胞,使其照顾特异的Tag barcode信息,再操纵GEXSCOPE
®微流控芯片捕捉单细胞。⚪细胞裂解后,GEXSCOPE
®分子标签磁珠通过捕捉成熟mRNA末端的poly-A,使细胞内mRNA和Tag barcode被加上不异的Cell Barcode。⚪逆转录成cDNA之后,别离停止Tag标签文库及单细胞转录组文库的构建,上机测序。
⚪得到下机数据,用开源软件CeleScope
®停止阐发,定量后得到样本的糖基化程度及单细胞转录组信息。亮点
选择ProMoSCOPE™,您能够得到:
⚪组分全面:试剂盒包罗转录组建库试剂组分及糖基化标识表记标帜及建库组分,无需购置额外的试剂。
⚪单细胞多组学:同时获得单细胞转录组和糖组学信息。
⚪高笼盖率:定量多种糖基化信息。
PART 03
序祯达助力单细胞多组学研究
糖组学手艺与基因组学和卵白量组学数据连系时,将会成为一种有力的多组学东西。若何在单细胞程度把糖组学数据和转录组学和表示型阐发的数据整合在一路,并给出生物学功用的解释是糖生物学正要答复的问题。
序祯达生物拥有多样化的单细胞多组学研究平台,可供给高通量单细胞转录组、基因组和卵白组研究阐发办事,关于各类肿瘤组织、骨髓、PBMC等临床样本,小鼠肝脏、脾脏、肿瘤等类型样本都具有丰硕的项目经历,撑持从样本处置,建库测序,到数据阐发的全流程办事。糖组学阐发产生的海量数据,可普遍应用到根底科研、药物靶点发现、新药开发、毒理学研究、疾病预防和诊断等范畴。
序祯达生物单细胞平台新品——ProMoSCOPE™高通量单细胞糖基化处理计划将在明日14:00初次播出,更多手艺细节及产物参数敬请存眷序祯达曲播间!
参考文献
[1] Schjoldager KT, Narimatsu Y, Joshi HJ, Clausen H. Global view of human protein glycosylation pathways and functions. Nat Rev Mol Cell Biol. 2020 Dec;21(12):729-749. doi: 10.1038/s41580-020-00294-x. Epub 2020 Oct 21. PMID: 33087899.
[2] RodrÍguez E, Schetters STT, van Kooyk Y. The tumour glyco-code as a novel immune checkpoint for immunotherapy. Nat Rev Immunol. 2018 Mar;18(3):204-211. doi: 10.1038/nri.2018.3. Epub 2018 Feb 5. PMID: 29398707.
[3] Pinho SS, Reis CA. Glycosylation in cancer: mechanisms and clinical implications. Nat Rev Cancer. 2015 Sep;15(9):540-55. doi: 10.1038/nrc3982. Epub 2015 Aug 20. PMID: 26289314.
材料来源:新格元
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序祯达生物介绍
序祯达生物总部位于上海自在商业尝试区外高桥保税核心功用区内,中心尝试室面积逾3000㎡,拥有大规模的高通量测序平台,供给300余项契合CLIA/CAP/ISO15189尺度的专业检测,同时撑持灵敏定造化的开发验证和检测阐发办事。公司以卓越测序手艺为核心,将办事才能从传统的基因组学、转录组学拓展至卵白组学、微生物组学,并成立了多组学整合阐发处理计划集合。
序祯达生物聚焦肿瘤免疫、细胞与基因治疗、疫苗等生物医药前沿范畴,在临床前研究、临床试验阶段及上市后阶段为造药企业、生物手艺公司和学术研究机构供给疾病致病机理探究、靶点及生物标记物发现、尺度化检测的办事撑持。
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