在那种情状下，雍正帝打起“变革”的大旗，以整顿吏治为切人点，清理国库亏空。雍正刚刚即位时，因为康熙晚年治理倒霉，官员贪污陈旧迂腐，国库亏空多达800万两 白银。雍正元年（ 1723年）正月，雍正以迅雷不及掩耳之势，电光石火般持续发布11道 谕旨，严厉警告各级文武官员：“不准暗通行贿，私受请托；不准库钱亏空，私纳苞苴；不准虚名冒饷，侵渔贪 婪；不准纳贿财贿，戕人之功；不准克扣运费，馈遗纳贿；不准多方讹诈，病官病民； 不准任意枉法，恃才多事。
”那些谕旨，层层下发，中心查处所、后任查前任，就连老苍生也被牵扯进来，雍 正告诉他们，谁也不准借钱给父母官员对抗亏空，如斯强大的力量和周全的办法，古未 有之。为了实在推行政策，雍正又设立会考府，负责国库的审计并对其出入情状停止整 顿。在雍正的严厉冲击之下，很多仕宦因亏欠国库银两被撤职抄家，以至方面大员，皇 亲国戚也绝不破例，例如曹雪芹的父亲江宁织造曹頫，以及和他有亲眷关系的苏州织造 李煦均因而获功。
如斯大规模，强力度的清欠工程收到了很好的效果。《清史稿•食货志》曾记载：“雍正初，整理财务，'收人颇增。”乾隆时史学家章 学诚也指出：“我宪皇帝（雍正）廓清吏治，裁革陋规，整饬官方，惩办贪墨，实为千 载一时。彼时居官，大法小廉，殆成风俗，贪冒之徒，莫不看风革面”。
到雍正末年，国库亏欠不只完全填补，还有数万万两余银。此外，雍正还创建“耗 羡回公”的政策以预防官员陈旧迂腐。“耗羡”是纳税时附加的货币损消耗，那也是官员贪 污的一个重要来源。雍正规定耗羡回公就是把征收的那一部门附加税回国库所有，做为 “养廉银”，用来奖励清廉的、有政绩的官员，是吏治的一猛进取。
雍正的性格和登上皇位的履历决定了他的执政风气：不会随便相信任何人，要把权 力紧紧挠在本身手里。在那一构想的指引下，在雍正期间，皇权得到了空前的加强。例如除了六部之外，提拔了其他中心政府机构的地位，如理藩院负责少数民族、藩 部事务和对外交涉等。
翰林院则掌管撰拟祝祭册诰文、编修册本、经筵日讲及部门科举 测验事务等。别的还有治理宫廷事务的外务府和掌管皇族事务的宗人府。外务府的官员 次要由宦官（寺人）担任。鉴于明朝宦官擅权的教训，清朝的宦官数量削减了良多，治理轨制也十分严厉，规 定寺人更高不克不及过四品，不克不及结交外臣，不得干涉朝政。
所有那些机构及此中下级机构 的仕宦任免均由皇帝一人认定，并且大小官员录用后都要进见皇帝才可上任，表现了清 代政权的高度集中。在处所上则设有曲隶、省、东北、边陲少数民族、八旗等行政机构。省以下为府、 县。省级最该长官为总督、巡抚，总督辖多省，一般不超越三个，巡抚只辖一省。
总督 巡抚互不统属，前者管军事、后者管民事。省级行政机构还设布政司、按察史，主管民 政、财务和刑事等。